fMRI预处理
Multiband (MB)
参考来源：Slice timing correction (STC) in multiband fmri (resting) - CONN toolbox；High-pass filter and ICA-AROMA on multiband-data；Slice timing correction - TR threshold
最早学习fMRI是在卢家锋老师的课程里（磁振影像原理與臨床研究應用），但自己的数据集是multiband采集的，如何进行slice timing的校正一直没有研究过。
Slice timing的问题可以参照这篇文章Slice-timing effects and their correction in functional MRI ，就是各个层面的数据不是在一个时间点采集的，这种时间差距在fMRI中被认为是需要校正的，因为本身就是研究BOLD信号，随时间变化比较敏感。
但是multiband的数据TR很短（1s左右），根据SPM的文档（Slice timing correction），得到这几个信息（这里没有对multiband本身的原理进行学习）：
长TR的数据中，slice timing correction (STC)没有坏处，可以提高统计效力。但根据非必要不插值的观念，STC不一定是必要的，并且头动严重时STC可能有问题；
短TR（≤2s）数据中，可以采用temporal derivative的方法（具体怎么操作没有细看）；
短TR数据中，同样可以进行STC，但通常来说是否进行STC的影响不大。如果要校正的话，要用slice timing（不知道具体数据的话也可以自己设置，也就是根据slice order，保证层间的差距一定，标准化到TR。个人理解就是相对于用slice order引入了TR的信息？）而非slice order进行校正；
如果需要使用Dynamic Causal Modeling (DCM)分析fMRI数据，multiband数据也要进行STC（这里DCM只SPM界面上的DCM，但我之前都没有用过这个功能）。
关于到底需不需要做STC，比如有没有明确的TR阈值，似乎没有定论。因此，我自己对于multiband fMRI的STC的态度是，只要不犯原则性的错误，那好像校正了也无妨。
fMRIPrep
mark：High-pass filter and ICA-AROMA on multiband-data（我似乎用不到ICA，但是里面对于slice和volume的含义和ICA-AROMA的意义可能可以借鉴）
fmriprep使用session的freesurfer结果：Can fMRIPrep use session specific freesurfer output to preprocess multiple sessions per subject?，但里面提到的Enable longitudinal structural analysis似乎目前为止还没有解决。
fMRIPrep的教程：参考了视频fMRIPrep_Tutorial
fMRIPrep的默认参数是可以正确地处理multiband fMRI的STC的（只要没有大量的头动和伪影），也不会有负面的影响（Slice time correction with multiband/short TR）。
CONN
参考Andy的教程（Functional Connectivity and the CONN Toolbox）进行预处理。CONN fMRI 功能连接 系列教程也是不错的学习资源。